А почему думаешь, что система не грузится из-за недостатка места на дисках?

Может быть, проблема с драйвером какого-то устройства. Или в автозапуске прописана программа, которая не может нормально запуститься и вешает систему. Это как варианты. В таких случаях в первую очередь нужно пробовать безопасный режим. В этом режиме отключены многие устройства, т.е. их драйверы не загружены и не могут мешать работе системы.
Проверить автозапуск, какие программы там сидят. Но не через ПУСК-Программы-Автозагрузка (там почти ничего не отображается), а утилитой для работы с реестром, например RegCleaner.

Нехватка свободного места на дисках, имеешь ввиду? Точно не знаю, сам не сталкивался. Безопасный режим помог?
Если получилось зайти в безопасном режиме - сразу же и проверь наличие свободного места:)

Колесико во всех окнах не работает, или только в каком-то одном? Т.е. попробуй им поработать в окне проводника и в окне Internet Explorer. Эффект одинаковый?

Не знаю. Может, драйвер мыши криво сработал, или еще чего... если перезагрузка помогла и дальше все нормально, зачем себе голову забивать:)

а что при отключени и мыши копм начинает пищать?

Смотря какие данные имеешь ввиду. Если документы, фото, музыку - это одно. А если хочешь сохранить установленные программы, чтобы на новой системе их заново не ставить и не настраивать - другое. Что именно?

На жестком диске нужно иметь как минимум два раздела. На первом, диске С, стоит операционка, на втором, третьем и т.д. - все остальное: документы, музыка, фотки и прочее. В этом случае, если операционка умирает, можно просто поставить новую, отформатировав диск С - данные останутся на других разделах в целости и сохранности. Кроме того, что было на Рабочем столе.
Чтобы сохранить настроенную операционку и иметь возможность развернуть ее на другой машине со всем, что там было раньше, можно сделать образ раздела, на котором она установлена. Естественно, в то время, когда она исправна. Такие образы делаются программами Acronis True Image, Norton Ghost и другими. Такой образ можно будет развернуть на чистом жестком диске, и операционка будет работать как ни в чем не бывало. Для того, чтобы такой образ можно было развернуть на другом компе, нужно при создании образа пользоваться специальными утилитами типа sysprep или Acronis Universial Restore.